La película es bastante fiel al libro, especialmente a su tercera parte, aquella en la que está centrada la película. Sin embargo, hay unas cuantas diferencias reseñables. El libro comienza con el trágico nacimiento de Grenouille mientras que la película inicia con el momento en que van a ejecutarlo, lo que nos lleva a un largo flashback; en la obra de Süskind, el protagonista pasa por más manos que la de su cuidadora al carecer de un olor propio, algo que le hace ser repudiado y considerado un ser casi diabólico, en la película no; en un capítulo de la novela Grenouille contrae ántrax, detalle que no aparece en la película; en la novela, el personaje de Baldini (encarnado por Dustin Hoffman) ha heredado los perfumes de su padre para su venta mientras que en la película este personaje es el autor de sus perfumes aunque está de capa caída.

Quizás el cambio más significativo entre el libro y la película esté en el aspecto físicamente muy degradado por la mala vida del protagonista de la novela en contraposición a la belleza física del protagonista de la película, en una clara concesión a la taquilla de la obra de Tykwer. Salvo este último caso, todos los cambios se traducen en simplificar el alambicado engranaje literario de Süskind para poder materializar una película que no llega a las dos horas y media de duración.